Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD4Q5VX71 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms