Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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