Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITRM1Q5JRX3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms