Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms