Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms