Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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