Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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DDB1Q16531 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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