Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms