Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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