Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 508.3 ms