Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms