Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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