Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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