Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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