Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RLFQ13129 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RLFQ13129 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RLFQ13129 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RLFQ13129 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RLFQ13129 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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