Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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MKRN3Q13064 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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