Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms