Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms