Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms