Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms