Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU5F1Q01860 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms