Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms