Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms