Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms