Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD3P84022 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms