Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRB1P82279 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRB1P82279 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms