Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms