Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A3P48764 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms