Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms