Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC1A1P43005 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms