Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms