Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms