Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms