Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCAP28676 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms