Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms