Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPD1P17405 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms