Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD4P09016 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD4P09016 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXD4P09016 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD4P09016 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD4P09016 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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