Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRPRAP08240 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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