Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms