Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF1P05230 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF1P05230 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF1P05230 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF1P05230 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms