Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF2P04141 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF2P04141 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF2P04141 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms