Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms