Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG7O95352 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG7O95352 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms