Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms