Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1AO15047 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms