Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms