Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NL46 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NL46 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms