Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms