Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms