Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms